苯酚法提取rna原理_trizol法提取rna步骤_苯酚法提取rna原理
洗涤剂的方法适用于组织培养细胞,样品悬浮在含有洗涤剂的裂解液中。 在 hek293 细胞中转染如图所示的质粒,20 小时之后收集细胞并用 anti-vsv 来富集蛋白, 然后在免疫印记实验中用 anti-ubiquitin 来检测免疫沉淀物的泛素化,同时用 anti-flag苯酚法提取rna原理, anti-ha and anti-vsv 来检测全细胞裂解液中 hect 家族 e3 连接酶、pcbp2、mavs 和。在 hek293 中转染 flag-aip4,并同时分别共转染如图所示 pcbp2 的野生型 和突变体分子(Δwb2 是去除了 wb2 的 pcbp2, del-l 是去除了连接区域的 pcbp2), 24 小时后收集细胞,用对照抗体 igg 和 anti-flag 来富集蛋白,用 anti-ha 来检测 pcbp2 和 aip4 的相互作用苯酚法提取rna原理,同时显示全细胞裂解液中这种标签蛋白表达(d)。
样品在与裂解液充分接触前决不能出现融化所以研磨用具必须预冷在碾磨过程中要及时补充液氮。样品研碎后在液氮刚刚挥发完时将样品迅速转移到含裂解液的容器中立即混匀匀浆。 4. 外源 RNA 酶的污染试剂器械及实验环境中的 RNA 酶进入实验系统。 5. 内源 RNA 酶的污染抑制剂失效或者用量不够实验样品过多匀浆时温度过高。 QOD260/OD280 比值偏低 A 1. 蛋白质污染确保不要吸入中间层及有机相。减少起始样品量确保裂解完全、彻底。加入氯仿后首先要充分混匀 并且离心分层的离心力和时间要足够。 如果所得RNA的OD260/OD280比值偏低则用氯仿重新抽提一次再沉淀溶解。 2.苯酚残留确保不要吸入中间层及有机相。加入氯仿后首先要充分混匀并且离心分层的离心力和时间要足够。 3.多糖或多酚的残留一些特殊的组织和植物中多糖、多酚含量较多这些残留也会导致OD260/OD280 比值偏低。因此从这类材料中提取 RNA 时需要注意多糖、多酚杂质的去除。 4.设备限制测定 OD260 及 OD280 数值时要使 OD260 读数在 0.1-0.5 之间。
此范围线性最好。用水稀释样品测 OD 值时对照及样品稀释液请使用 10mM TrispH7.5。用水作为稀释液将导致比值偏低。QRNA 提取得率低 A 1. 该组织或者细胞中 RNA 含量偏低不同细胞和组织中 RNA 的丰度不同如肝脏胰腺心脏等是高丰度组织(总 RNA 含量 2-4μg/mg)脑胚胎肾脏肺胸腺卵巢等是中丰度组织(总 RNA 含量 0.05-2μg/mg)膀胱骨脂肪等是低丰度组织(总 RNA 含量<0.05μg/mg)。 2. 组织起始量太少或者太多样品量过少则细胞组织中 RNA 含量较低样品量过多则可能超过裂解液的裂解能力裂解将不完全从而导致 RNA 得率低。核糖体 RNA(ribosomal RNArRNA)是组成核糖体的主要成分。核糖体是合成蛋白质的工厂。在大肠杆菌中rRNA 量占细胞总 RNA 量的 75%-85%而 tRNA 占 15%mRNA 仅占 3-5%。 rRNA 一般与核糖体蛋白质结合在一起形成核糖体ribosome如果把 rRNA 从核糖体上除掉核糖体的结构就会发生塌陷。
混匀,室温放置15分钟后,3500 转/分 4℃离心20 min,弃上清液,测沉淀cpm数。(2)所有步骤均在4℃下进行,匀完浆后冰上放置30min.,4℃10000×g离心10min,取上清(如果无法沉淀,请加大离心力,操作40min之后需要再加pmsf,加量同1,如信号转导、转录因子类蛋白易降解,可添加aprotinin、benzamidine、navo4等蛋白酶抑制剂)。11.于室温用70%的乙醇洗涤沉淀物和管壁,室温12000 rpm离心,15min,充分弃去乙醇,于室温将离心管倒置在纸巾上,使最后残余的痕量乙醇挥发殆尽。
2内外筒循环强水流,例如松下的离心洗,lg的dd直驱系列,通过波轮和内桶的同步旋转让夹层中的水流快速循环增加洗涤剂的溶解同时也能同步清洗夹层,不过两者都有自己的弊端,lg最低和最高水位无法启动该水流,松下也在弱化离心洗的功能,未来有可能取消该功能,推测是因为电机负荷的原因,现在的离心洗转速已经弱于以往产品了。25 ℃下12 000 r·min - 1离心20 min ,倒出上清液,干燥后加入500μl 去离子水,溶解粘附于离心管壁的dna/index.html'>dna 及其杂质,并收集于1.5 ml 的微型离心管中。g/ml )的te(ph8.0)溶解沉淀,将溶液转到一微量离心管中,于室温放置30分钟。
3.操作过程中应始终戴一次性橡胶手套,并经常更换,以防止手、臂上的细菌和真菌以及人体自身分泌的rna酶带到试管或污染用具,尽避免使用一次性塑料手套。5.稀释精油时切勿使用塑料器皿,油彩器皿或易溶解器皿,需使用玻璃或陶瓷器皿。(四)器皿使用后随时清洗,染菌后应严格高压灭菌,不得乱弃乱扔。
匀浆化时组织样品容积不能超过 TRIZOL 容积的 10%。 ⑦单层生长的细胞 直接往直径 3.5 cm 的培养板中加入 1ml 的 TRIZOL 溶解细胞通过移液管分次移出细胞裂解物 。 依据培养板的面积而不是依据细胞的数量来决定所需的TRIZOL量 每10 cm2加 1 ml。当 TRIZOL 量不足时可导致抽提的 RNA 中污染有 DNA。 ⑧在匀化后和加入氯仿之前样品可以在–60—–70°C 保存至少一个月。RNA 沉淀RNA 洗脱溶于 75%的乙醇在 2—8°C 至少可以保存一周在–5—–20°C 下至少可保存一年。 5.试剂盒 ①组织裂解液TaKaRa RNAiso Reagent大连宝生物 Takara 公司 ②逆转录试剂盒Revert Aid First Strand cDNA Synthesis KitMBI 公司 6.所需实验耗材 ①无菌且灭活 RNA 酶的枪头200μ l 和 20μ l ②0.01% (v/v) DEPC 处理水 ③冰盒 ④EP 管 ⑤0.2ml 的 PCR 反应管 ⑥氯仿 ⑦异丙醇 ⑧75%乙醇用 DEPC 水配制 实时荧光定量 PCRReal time-PCR 一.原理利用荧光信号的变化实时检测 PCR 扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化通过 Ct值和标准曲线的分析对起始模板进行定量分析。
酶联荧光免疫体系中的关键部分在于生物活性物质的固定和荧光底物的选择,本文试发展几种新的荧光底物用于酶联荧光免疫体系的检测。4.荧光定量pcr的ct值太高(荧光定量,目的基因,引物浓度,梯度)。具体实施例方式以疏水染料作为荧光探针,首先测定了表面活性剂的临界胶束浓度,然后在表面活性剂临界胶束浓度以下,表面活性剂与带相反电荷的聚电解质通过疏水与静电作用形成超分子组装体,疏水染料包埋于组装体内腔,最后加入对聚电解质有水解作用的酶,将高分子量的聚电解质催化水解为低分子量的聚电解质,诱导组装体解组装,使组装体内腔包埋的荧光探针释放,通过荧光强度的降低来实现酶活性的检测。
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