核苷酸序列同源性分析

利用叶绿体基因组进化中高度保守的特点,根据烟草叶绿体基因组全序列设计合成引物,从菊苣叶绿体基因组中扩增包括rps7-rps12-trnv-16s-rdna基因在内的一段序列(genbank登录号为gq199478),并以此作为定点整合外源基因的同源重组片段.以叶绿体基因强启动子prrn驱动选择标记基因aada及报告基因gfp构建多顺反子表达盒prrn-aada-gfp-psba-3′,然后将表达盒克隆进菊苣叶绿体同源片段中,获得菊苣叶绿体定点整合表达载体pjag,酶切分析证明所构建的载体符合预期设计.该载体的构建为建立菊苣的叶绿体转化体系奠定基础,为进一步通过叶绿体基因工程手段将更多感兴趣的基因导入菊苣进行遗传改良,或以菊苣叶绿体作生物反应器生产动物口服疫苗等搭建技术平台.。从基因分离克隆的方法进行分类可分为三类：一种类型是功能克隆，即根据已知基因的产物推断出其相应核苷酸序列，再根据此序列合成寡聚核苷酸探针。与昆虫ugt间同源性最低,与家蚕ugt间同源性为41%.ecor i-o片段+m13端含有编码olnpv orf129(ol-129)ol-129同源基因orf,由597 bp个核苷酸组成,在其起始密码子atg上游-64,-24 nt处各有1个tata box,其推测的氨基酸序列与ol-129同源性最高达81%,与ldnpv orf127同源性最低,为40%.明确了orernpv ecor i-o 片段的序列特征,以及orernpv egt 基因特性.。

实验动物科学2008年05期MHC;DRB3.2基因;核苷酸序列;同源性分析;

但必须首先纯化该基因的编码蛋白，并测定6个以上的末端氨基酸序列，通过反推的核苷酸序列合成一套寡核苷酸探针。与昆虫ugt间同源性最低,与家蚕ugt间同源性为41%.ecor i-o片段+m13端含有编码olnpv orf129(ol-129)ol-129同源基因orf,由597 bp个核苷酸组成,在其起始密码子atg上游-64,-24 nt处各有1个tata box,其推测的氨基酸序列与ol-129同源性最高达81%,与ldnpv orf127同源性最低,为40%.明确了orernpv ecor i-o 片段的序列特征,以及orernpv egt 基因特性.。rgd为存在于许多糖蛋白配体中的氨基酸序列,对整合素具有识别作用.此序列也发现于许多蛇毒去整合素分子中.采用基因克隆技术从大连产白眉蝮蛇的毒腺中克隆出的去整合素adinbitor是含73个氨基酸残基的去整合素,分子中含有12个半胱氨酸和rgd模体.实验证明,adinbitor作为去整合素的新成员,具有典型的抗adp诱导的人血小板聚集作用和抗肿瘤血管新生作用.为了将adinbitor的这2种功能分开,采用pcr基因定点突变的方法,将其cdna序列中rgd模体改变成kgd.重组adinbitor(kgd)在e.coli bl21得到表达,并通过his·。

高技术通讯2003年06期节旋藻(螺旋藻);Rubisco基因;氨基酸序列;核苷酸序列同源性分析;

摘要: [各位：引物设计实在令我头疼（谢谢大家）(引物设计,碱基,上游引物,下游引物)] 以下为我的目的基因序列 1 gatagatatc tatgaataag cacagaagtg cgctgagaag attcagaatg tcaatgatgc61 gacgatctct catattggca gtgttatctg tcacgagtca caactcacga ttcttggcat121 cgcccattcg aggtatatgt atgaggaccg gtc 关键词:[引物设计 上游引物 碱基 下游引物 碱基序列 目的基因序列]……。红色字体即为ssr位点，在得到这些ssr位点后，就可以直接拿来设计引物，引物设计软件很多核苷酸同源性，我一般习惯使用ncbi的在线引物设计，因为玉米的基因组序列已存在，当其设计好引物后，会自动在数据库里搜索一翻，如果匹配到其他位点上，给出的引物报告单会自动注明核苷酸同源性，可以选择是否用该标记。11.如何进行引物设计在ncbi的genebank里怎么查基因的序列(序列,基因,引物设计,引物)。

武汉科技大学学报(自然科学版)2006年05期牦牛;BLG基因;同源性分析;

目的研究柯萨奇B4病毒(CVB4jlu06株)5′UTR基因序列及变异性,探讨其致病性的分子生物学基础。方法 Hep-2细胞扩增病毒,RT-PCR扩增5′UTR基因片段,测序后进...详情>>

中国实验诊断学2012年07期柯萨奇病毒;核苷酸序列;遗传进化;

我们通过对59株菌的opt基因序列分析发现，所有25株xv血清型菌株均携带optⅡ基因，1株yv血清型菌株携带optⅢ基因，3株x血清型菌株携带失活的optⅡ基因，其他菌株均未携带opt基因。通过扫描64株菌基因组上的耐药岛及耐药基因后发现，st91序列型自20世纪90年代初期(1993年)开始出现，通过获得srl和tn7两个多重耐药岛以及喹诺酮类药物的耐药基因gyra上2个非同义突变，最终成为我国的优势克隆群。测定阳性重组质粒的p32基因和itr豫基因核苷酸序列，与genbank收录的其他6株羊痘病毒和2株牛 皮肤疙瘩病毒基因核苷酸进行比较分析，绵羊痘病毒itr极易反复你序列的同源性为100%，与羊痘病毒属的山羊痘病毒的同源性也高达98.3%以上。

黑龙江畜牧兽医2012年19期鸡源致病性大肠杆菌;耶尔森菌毒力岛(HPI);irp2基因;fyuA基因;

正戊型肝炎病毒(HEV)感染是目前在发展中国家和发达国家引起急性肝炎的主要病原之一。根据核苷酸序列同源性分析,目前公认的HEV基因型有4个,分别为1、2、3和4型。此外,有人认为...详情>>

中国病毒病杂志2012年06期戊型肝炎病毒;神经系统疾病;吉兰-巴雷综合征;急性横贯性脊髓炎;

在建立和完善北方地区鱼类疫病的流行病学调查研究时,从丹东鸭绿江一网箱养殖场患病鳜鱼中分离到了一株优势菌株。对该菌株进行营养琼脂及绵羊血琼脂培养基培养、革兰氏染色镜检、Vitek细...详情>>

中国动物检疫2012年06期鳜鱼;嗜水气单胞菌;分离;鉴定;

应用磁珠富集法开发银鲫的三、四核苷酸重复的微卫星。生物素探针分别为Probe-(TGA)8,Probe-(AGAC)8,Probe-(GATT)8,结果得到4740个菌落。结合同...详情>>

水产学杂志2010年04期银鲫;微卫星;磁珠富集法;in;silico;BLAST;

目的:研究柯萨奇B3病毒(CVB3)/MKP株5'非编码区基因序列及变异性,探讨其致病性的分子基础。方法:用Hela细胞培养柯萨奇B3病毒,RT-PCR法扩增5'非编码区,测序后...详情>>

中国妇幼保健2013年34期柯萨奇B3病毒;基因序列;系统发生树;

为了解猪博卡病毒(PBoV)的基因组结构和遗传进化规律,并研究可行的PBoV基因分型方法,本研究利用GenBank中登录的28条PBoV全基因组序列信息,采用DNAStar生物信...详情>>

中国预防兽医学报2014年02期猪博卡病毒;遗传进化分析;基因分型;